フリーランスの方の確定申告で多い間違いの１つとして「支払調書ベースで売上を計上している」というものがあります。
支払調書には、その年に支払った（支払うべき）金額を記載します。
支払調書の金額≒現金主義と思ってください。
一方、事業所得の売上計上は発生主義で計上します。
詳細は先日の記事をご参照ください。
関連記事 ： 【確定申告】ここだけは押さえてほしい記帳する際のチェックポイント
月末締め翌月末払いのようなケースでは必ずズレが生じます。
では、結論としてどうすれば良いのかといいますと
・帳簿の売上は発生主義で記帳する。
・源泉所得税は現金主義だと思っていただいて結構です（実際には違いますが難しいので省略）。
・そもそもですが、確定申告書に支払調書の添付義務はありません。
ただし、給与所得の源泉徴収票の添付は義務です（電子申告の場合は省略可能）。
税務署の方でもたまに勘違いされている方もいますので、ズレの原因を一言書いてあげると良いでしょう。
変な問い合わせが来ると、精神衛生上よろしくありませんので。
